MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 58948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	AAG	2	6	3121	3126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
2	NC_021839	ATTA	2	8	3164	3171	50 %	50 %	0 %	0 %	525929674
3	NC_021839	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
4	NC_021839	GTG	4	12	3225	3236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
5	NC_021839	ATT	2	6	3248	3253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929674
6	NC_021839	ATGA	2	8	3263	3270	50 %	25 %	25 %	0 %	525929674
7	NC_021839	TC	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	525929674
8	NC_021839	GAA	3	9	3362	3370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
9	NC_021839	TAA	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929674
10	NC_021839	GAA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929674
11	NC_021839	TGG	2	6	3399	3404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929674
12	NC_021839	TTTACC	2	12	3430	3441	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525929674
13	NC_021839	GAT	2	6	3517	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
14	NC_021839	CAA	2	6	3563	3568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929675
15	NC_021839	CT	4	8	3630	3637	0 %	50 %	0 %	50 %	525929675
16	NC_021839	CTT	2	6	3691	3696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929675
17	NC_021839	AGA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929675
18	NC_021839	TTGT	2	8	3735	3742	0 %	75 %	25 %	0 %	525929675
19	NC_021839	ATT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929675
20	NC_021839	A	6	6	3863	3868	100 %	0 %	0 %	0 %	525929675
21	NC_021839	GAG	2	6	3965	3970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525929675
22	NC_021839	GCT	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929675
23	NC_021839	TGA	2	6	3994	3999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929675
24	NC_021839	AATG	2	8	4032	4039	50 %	25 %	25 %	0 %	525929675
25	NC_021839	TGA	2	6	4080	4085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
26	NC_021839	GAT	2	6	4087	4092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
27	NC_021839	GTT	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
28	NC_021839	GAAG	2	8	4161	4168	50 %	0 %	50 %	0 %	525929676
29	NC_021839	TTG	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929676
30	NC_021839	ATA	2	6	4178	4183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929676
31	NC_021839	TGA	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
32	NC_021839	TGG	2	6	4256	4261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929676
33	NC_021839	ATG	2	6	4285	4290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
34	NC_021839	GAA	2	6	4327	4332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
35	NC_021839	TAT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
36	NC_021839	ATT	2	6	4398	4403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
37	NC_021839	TG	3	6	4495	4500	0 %	50 %	50 %	0 %	525929676
38	NC_021839	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	525929676
39	NC_021839	ACA	2	6	4558	4563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929676
40	NC_021839	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	525929676
41	NC_021839	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
42	NC_021839	ATT	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929676
43	NC_021839	AAG	2	6	4853	4858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
44	NC_021839	A	6	6	4925	4930	100 %	0 %	0 %	0 %	525929676
45	NC_021839	TGAA	2	8	4931	4938	50 %	25 %	25 %	0 %	525929676
46	NC_021839	T	6	6	4962	4967	0 %	100 %	0 %	0 %	525929676
47	NC_021839	GAGAA	2	10	4968	4977	60 %	0 %	40 %	0 %	525929676
48	NC_021839	AGA	2	6	5001	5006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929676
49	NC_021839	ATG	2	6	5052	5057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929676
50	NC_021839	ATG	2	6	5084	5089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
51	NC_021839	AAG	2	6	5136	5141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
52	NC_021839	GAACA	2	10	5172	5181	60 %	0 %	20 %	20 %	525929677
53	NC_021839	TTA	2	6	5186	5191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929677
54	NC_021839	GCG	2	6	5219	5224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
55	NC_021839	CT	3	6	5229	5234	0 %	50 %	0 %	50 %	525929677
56	NC_021839	GCA	2	6	5263	5268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
57	NC_021839	GAC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
58	NC_021839	A	6	6	5336	5341	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
59	NC_021839	GAACA	2	10	5394	5403	60 %	0 %	20 %	20 %	525929677
60	NC_021839	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929677
61	NC_021839	ACAA	2	8	5539	5546	75 %	0 %	0 %	25 %	525929677
62	NC_021839	GTC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
63	NC_021839	GAA	2	6	5680	5685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
64	NC_021839	CAA	2	6	5747	5752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
65	NC_021839	TGT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
66	NC_021839	GTG	2	6	5841	5846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
67	NC_021839	A	6	6	5864	5869	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
68	NC_021839	TATT	2	8	5907	5914	25 %	75 %	0 %	0 %	525929677
69	NC_021839	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
70	NC_021839	GCC	2	6	5983	5988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929677
71	NC_021839	GTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
72	NC_021839	CAA	2	6	6021	6026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
73	NC_021839	AT	3	6	6046	6051	50 %	50 %	0 %	0 %	525929677
74	NC_021839	TGC	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
75	NC_021839	GA	3	6	6071	6076	50 %	0 %	50 %	0 %	525929677
76	NC_021839	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
77	NC_021839	TGA	2	6	6181	6186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
78	NC_021839	GCT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
79	NC_021839	TGA	2	6	6265	6270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
80	NC_021839	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
81	NC_021839	A	6	6	6350	6355	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
82	NC_021839	AGC	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929677
83	NC_021839	A	6	6	6428	6433	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
84	NC_021839	AGA	2	6	6439	6444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
85	NC_021839	AGA	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
86	NC_021839	TTG	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
87	NC_021839	GTT	2	6	6515	6520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929677
88	NC_021839	TGC	2	6	6622	6627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929677
89	NC_021839	CG	3	6	6746	6751	0 %	0 %	50 %	50 %	525929677
90	NC_021839	TGA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
91	NC_021839	GAT	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
92	NC_021839	CTC	2	6	6846	6851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525929677
93	NC_021839	GAA	2	6	6869	6874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
94	NC_021839	AGT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
95	NC_021839	GGT	2	6	7015	7020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929677
96	NC_021839	TCA	2	6	7038	7043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929677
97	NC_021839	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929677
98	NC_021839	AAG	2	6	7392	7397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
99	NC_021839	GAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929677
100	NC_021839	A	7	7	7492	7498	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
101	NC_021839	A	6	6	7507	7512	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
102	NC_021839	AAC	2	6	7516	7521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929677
103	NC_021839	A	6	6	7525	7530	100 %	0 %	0 %	0 %	525929677
104	NC_021839	AACA	2	8	7545	7552	75 %	0 %	0 %	25 %	525929677
105	NC_021839	TG	3	6	7722	7727	0 %	50 %	50 %	0 %	525929678
106	NC_021839	ATGG	2	8	7755	7762	25 %	25 %	50 %	0 %	525929678
107	NC_021839	A	7	7	7818	7824	100 %	0 %	0 %	0 %	525929678
108	NC_021839	TTA	2	6	8008	8013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929678
109	NC_021839	A	6	6	8047	8052	100 %	0 %	0 %	0 %	525929678
110	NC_021839	TA	3	6	8059	8064	50 %	50 %	0 %	0 %	525929678
111	NC_021839	GAA	2	6	8071	8076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
112	NC_021839	CAAA	2	8	8082	8089	75 %	0 %	0 %	25 %	525929678
113	NC_021839	GCGG	2	8	8097	8104	0 %	0 %	75 %	25 %	525929678
114	NC_021839	GATT	2	8	8175	8182	25 %	50 %	25 %	0 %	525929678
115	NC_021839	ATC	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929678
116	NC_021839	TTG	2	6	8330	8335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929678
117	NC_021839	GAAG	2	8	8346	8353	50 %	0 %	50 %	0 %	525929678
118	NC_021839	TCA	2	6	8421	8426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929678
119	NC_021839	GAA	2	6	8545	8550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
120	NC_021839	GGAA	2	8	8592	8599	50 %	0 %	50 %	0 %	525929678
121	NC_021839	TAA	2	6	8685	8690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929678
122	NC_021839	AGC	2	6	8763	8768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929678
123	NC_021839	TGG	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929678
124	NC_021839	CAGT	2	8	8813	8820	25 %	25 %	25 %	25 %	525929678
125	NC_021839	CAA	2	6	8846	8851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929678
126	NC_021839	TCG	2	6	8898	8903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929678
127	NC_021839	AAC	2	6	8918	8923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929678
128	NC_021839	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
129	NC_021839	GAA	2	6	9045	9050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929678
130	NC_021839	GT	3	6	9220	9225	0 %	50 %	50 %	0 %	525929679
131	NC_021839	T	6	6	9225	9230	0 %	100 %	0 %	0 %	525929679
132	NC_021839	TAAT	2	8	9305	9312	50 %	50 %	0 %	0 %	525929679
133	NC_021839	TTA	2	6	9356	9361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929679
134	NC_021839	CAAA	2	8	9508	9515	75 %	0 %	0 %	25 %	525929679
135	NC_021839	AGT	2	6	9534	9539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929679
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265	NC_021839	ATT	3	9	16181	16189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929686
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271	NC_021839	ATGG	2	8	16665	16672	25 %	25 %	50 %	0 %	525929687
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